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New York, New York, United States
我叫江奕賢啦

2022年4月27日

沒資金沒病人照樣每五分鐘做一個癌症基因研究

舉個例子, 比如說 我知道我因為基因裡面rs2839698帶AA, 所以H19這個基因在膽管癌的表現會較高. 詳見這篇paper.

我想知道這件事對我的存活率影響有多大.

這時候 搜尋一下 pubmed, 還沒有這樣的paper, 這時候 我就可以拿出下面這個database, 立馬統計一下.

http://gepia2.cancer-pku.cn/#survival

Gene: H19

methods: overall survival

group cutoff: median

datasets: CHOL

就可以得到下圖了.

在膽管癌病人中 如果H19高, 跟H19低的比, 則五年存活率大概會少一半.

一兩分鐘就可以得到結果, 不用等一兩年!

上面的範例是看某個基因的表達量會怎樣影響存活率
如果是要看某基因突變會怎樣影響存活率 可以用下面這個database
https://www.cbioportal.org/