沒資金沒病人照樣每五分鐘做一個癌症基因研究
舉個例子, 比如說 我知道我因為基因裡面rs2839698帶AA, 所以H19這個基因在膽管癌的表現會較高. 詳見這篇paper.
我想知道這件事對我的存活率影響有多大.
這時候 搜尋一下 pubmed, 還沒有這樣的paper, 這時候 我就可以拿出下面這個database, 立馬統計一下.
http://gepia2.cancer-pku.cn/#survival
Gene: H19
methods: overall survival
group cutoff: median
datasets: CHOL
就可以得到下圖了.
在膽管癌病人中 如果H19高, 跟H19低的比, 則五年存活率大概會少一半.一兩分鐘就可以得到結果, 不用等一兩年!
上面的範例是看某個基因的表達量會怎樣影響存活率
如果是要看某基因突變會怎樣影響存活率 可以用下面這個database
https://www.cbioportal.org/